《特赦1959》作为一个主旋律献礼剧，总体来说还算是不错的，但也有一些问题，最明显的就是很多网友已经指出过的，整个剧的跨度达十年以上，但剧中的人物始终穿着棉衣，一直在冬天，这是很不合理的。还有一些本该有的情节和人物没有，却硬生生的强加了许多虚构的情节和人物，让这个剧打了折扣。
而其中最为明显的让人感觉多余而且很烦人的角色，当然就是记者徐高平(孙仲秋 饰)和护士梁冬芳(奚望 饰)，这两个虚构的人物的戏有点太多了。本来这个剧中的很多老演员的表演已经很精彩了，但是这两个人一出现，瞬间就让人感觉跳戏跳到现在流行的那种偶像剧去了，尤其梁冬芳还是一副傻白甜的样子，很没有必要。如果能像《亮剑》和《士兵突击》一样，就拍成一部男人戏，其实剧情会更紧凑，也会让观众感觉更严肃。
还有一些人物的虚构，比如蔡守元(马仑 饰)这个人物，表面上是综合了很多人的经历，尤其是张淦和范汉杰的一部分经历，但这个改编其实意义不是很大，还不如直接让范汉杰和张淦真名实姓的出现在剧中，反而效果会更好。因为范汉杰没有出现，廖耀湘(嵇建 饰)的台词太少，戏也很少，导致整个剧中辽沈战役中被俘的国军高级将领中，戏最多的反而成了廖耀湘指挥的四十九军军长中将郑庭笈(侯伊建 饰)。
还有刘安国(米学东 饰)这个角色，其实所有人一眼都能看出来，这个虚构的人物的原型就是文强。在以前的老电影《决战之后》中，文强是真名实姓的出现的，但是到了这个剧里，却被改编成了刘安国。不过，刘安国这个人物形象总体而言还是比较饱满的，也比较出彩，这和演员本身的拿捏、把握和表演比较到位是分不开的，刘安国也是这个剧中的几个主要角色之一。但反过来说，如果把刘安国的名字换成文强，其实也一样可以这么处理，也不会让人跳戏。
因为主要角色都是被俘的国军高级将领，其中一些人还有上下级关系，比如郑庭笈是廖耀湘的下属，文强在淮海战役中被俘的时候是杜聿明(肖荣生 饰)的下属，融合了杨伯涛(耿懿 饰)的经历的陈瑞章是黄维(徐成峰 饰)的下属等等，那么这些人在一起，讨论过往的战役中各自的表现，这肯定是少不了的，也是应该浓墨重彩的表现的。但这个剧中反映得却有点少了，比较集中的反而是虚构的人物蔡守元和在鲁南战役中被俘的马励武(齐庆林 饰)争论，但这个剧情和史实完全对不上。
还有黄维和杜聿明、王耀武(赵恒煊 饰)等几个主要角色，黄维和杜聿明是不同的派系，黄维是陈诚土木系，而杜聿明是何应钦系的人，这也是杜聿明在淮海战役中对救援黄维不太积极的原因，但在剧中两个人却相安无事，并没有讨论淮海战役的得失。作为整个剧中两个比较主要的角色，又都亲历了决定国共双方命运的淮海战役，两个人对此却闭口不提，相互之间既没有讨论，也没有埋怨和指责，这也是不太符合逻辑的。
还有剧中被当成主要反面典型人物处理的几个特务，包括康泽(左百学 饰)、刘安国、沈醉(姚扩 饰)、徐远举(牛志强 饰)、周养浩(宋楚炎 饰)、曾扩情，其实处理得也都还不错，只不过，这个处理可能稍微有点过头了。因为，相比其他在战争中被俘的国军高级将领而言，这些特务对党国的忠诚度似乎太高了一点，很可能会让一些观众想起普京的故事。不过，这几个特务的形象总体而言还是控制住了，比较猥琐，不像《潜伏》里的李涯那样忠诚，以至于感动了观众。